项目评估委员会同意对该项目继续予以第二轮的资助，并认为项目在第一轮资助中取得了如下重要成果和社会影响：
从2019-2024年，通过连续多年开展的鸟类繁殖季及春秋迁徙季的调查与监测，项目团队已初步掌握了长门岩岛及周边海域迁徙鸟类的种类、数量、迁徙规律、优势种等本底状况。同时项目还比较系统地掌握了以黄嘴白鹭、黑尾鸥、黑叉尾海燕为重点的主要繁殖海鸟在长门岩岛的繁殖规律、栖息地特征、种群数量及其年季间的动态变化。项目通过与科研单位的合作，开展了GPS卫星跟踪，掌握了黄嘴白鹭和黑尾鸥的觅食区域、迁徙路线、迁徙行为、迁徙规律和越冬地等信息，填补了该岛及附近海域迁徙和繁殖鸟类在生物学、生态学和生存状态等多方面本底信息的空白，证明了该岛是重要的海鸟繁殖地和栖息地，且位于猛禽等鸟类迁飞的重要通道上，具有非常重要的生态保护价值。

本项目的调查和监测结果显示：五年内，长门岩岛及周边海域共记录到19目54科183种，总数近5万只鸟类个体。其中被IUCN红色名录评估为全球易危物种的有黄嘴白鹭、乌雕、遗鸥、东亚蝗莺和田鹀；国家一级重点保护动物5种，分别为遗鸥、黑嘴鸥、黄嘴白鹭、乌雕和黄胸鹀；包括海鸬鹚在内的国家二级重点保护动物22种，其中15种为猛禽。此外，监测数据还显示，长门岩岛黑尾鸥数量较为稳定，数量一直维持在4800-5300巢，南北两岛适合黑尾鸥繁殖的栖息地已全被利用，预期其种群数量已达上限，并将持续维持在11000只左右；黑叉尾海燕的繁殖种群大概在3500只左右；黄嘴白鹭的繁殖巢则一直处于增长状态，从2019年的38巢增长到2024年的61巢，但由于岛上可供使用的巢址有限、竞争激烈，其繁殖种群可增长的余地已非常有限。

长门岩岛在项目开始之前迁徙和繁殖鸟类面临的主要威胁是鸟网、鸟蛋捡拾和山羊等外来物种对鸟类繁殖和栖息地的干扰。项目通过与海岛驻军开展军民共建和鸟类科普宣讲工作，推动驻军建立了常态化的巡护和反盗猎机制，对任何可疑登岛船只进行喊话驱离。同时项目通过与林草、自然资源管理和规划、海监、检察院等地方职能部门开展有效的沟通、分享监测数据、提交相关保护措施建议、合作开展普法宣传和社区倡导工作、竖立警示牌、清理海岛外来物种等工作，现阶段已建立起一个由民间组织-政府部门-驻军多方联合的可持续的长门岩岛鸟类保护机制。通过上述工作已杜绝了长门岩岛上的网鸟现象，清除了废弃渔网及其对海鸟的威胁，清除了山羊及其对植被和繁殖鸟巢的危害，杜绝了繁殖期大量捡拾鸟蛋的现象，使得捡拾鸟蛋的威胁降到了最低。

在下一轮的实施周期里，针对长门岩岛的周边海岛在迁徙季仍较为普遍存在的网鸟盗猎现象（主要针对猛禽和雀形目鸟类）等问题，项目拟将临近长门岩岛的大管岛、小管岛和潮连岛也纳入鸟类监测和保护的范围。除在长门岩岛开展常规性的监测外，大小管岛将以迁徙鸟类为重点，潮连岛则以繁殖海鸟为重点，开展系统的调查监测工作，以期更全面地掌握这几个海岛及周边海域鸟类的种类、数量、分布、迁徙和繁殖规律。项目将深入社区建立以当地志愿组成的巡护队伍，开展有针对性的大小管岛迁徙季巡护工作，联合执法部门打击盗猎行为。在现阶段已建立的多方保护机制基础上，项目还将进一步明确各合作方的需求、职责、成长方向，使该机制完成由被动到主动的蜕变，从而推动当地主管部门制定和实施海岛鸟类保护计划，推动建立一个以长门岩岛为核心，辐射大管岛、小管岛、潮连岛等对于鸟类迁徙或繁殖具有重要生态功能的有效保护区域，打造黄渤海海岛鸟类保护示范区。